Výzkumný pracovník (SKO1109) v oblasti klinické výpočetní proteomiky – dvouletá pozice

Hledáme výzkumného pracovníka (SKO1109) na plný úvazek na dobu dvou let. Pozice je zaměřena na klinickou proteomiku s využitím hmotnostní spektrometrie nebo výpočetní proteomiku a je součástí Norského výzkumného centra pro celiakii při Ústavu klinické medicíny.

Pozice je součástí projektu s více hlavními řešiteli, který propojuje výzkumné skupiny profesora Ludviga M. Sollida z Oddělení imunologie Ústavu klinické medicíny Lékařské fakulty, profesora Knuta Lundina z Universitní nemocnice v Oslu a Dr. Jorunn Stamnæs z Proteomického základního pracoviště Universitní nemocnice v Oslu.

O čem projekt je

Srdcem projektu je zdokonalení molekulárního měřítka poškození střeva – tzv. proteomického skóre biopsie – vyvinutého naším výzkumným centrem. Toto skóre převádí proteomická data ze střevní tkáně do jediné číselné hodnoty, která slouží jako ukazatel nemoci. Dokáže přesně posoudit, jak se střevo hojí při bezlepkové dietě nebo naopak jak se poškozuje při opětovném zařazení lepku do stravy. V aktuálním projektu skóre přizpůsobíme tak, aby cíleně sledovalo zánětlivé procesy ve střevě, a budeme korelovat proteomická data z tkáně biopsie s proteomickými daty ze séra. Výsledky projektu přinesou zásadní poznatky o bezpečnosti nízké expozice lepku u celiaků.

Jako výzkumný pracovník se budeš věnovat proteomické analýze klinických vzorků pomocí hmotnostní spektrometrie a bioinformatickému zpracování takto získaných dat. Budeš součástí multidisciplinárního týmu zaměřeného na translační a klinický výzkum celiakie. Pracoviště je rozděleno mezi Ústav imunologie Universitní nemocnice v Oslu – Rikshospitalet a Proteomické základní pracoviště (PCF), které na podzim 2026 přesídlí do nové budovy Life Science Building v těsném sousedství nemocnice. PCF je hlavním centrem proteomických služeb, výuky a výzkumu v osloském regionu a zároveň vedoucím uzlem Národní sítě pro pokročilou proteomickou infrastrukturu (NAPI).

Délka pracovního poměru: 2 roky.

Co od tebe očekáváme

• Ph.D. v oboru biologie, imunologie, experimentální systémové biologie, bioinformatiky nebo příbuzném oboru.
• Zkušenosti se statistickými metodami a programováním využívaným při analýze „omics" dat – podmínka.
• Zkušenosti s analýzou proteomiky zdola nahoru (bottom-up), kvantitativními proteomickými postupy a zpracováním dat – výhodou.
• Zkušenosti s výzkumnými projekty zahrnujícími biologickou interpretaci nebo validaci omics dat z buněk nebo tkání savců – výhodou.
• Plynná angličtina v mluvené i písemné podobě.

O nás

Jsme otevřená a mezinárodně orientovaná univerzita, která usiluje o inkluzivní a různorodé pracovní prostředí. Věříme, že naši práci děláme nejlépe tehdy, když v týmu spojíme různé zkušenosti, zázemí a pohledy na věc. Hledáme skvělé kolegy – mohl(a) bys být jedním z nich?

Pokud máš specifické potřeby, rádi se jim přizpůsobíme – ať už jde o úpravu pracovní doby, zadaných úkolů, digitální či fyzické podmínky nebo jiná praktická opatření.

Pokud máš přistěhovalecké zázemí, zdravotní omezení nebo mezery v životopisu, neváhej to uvést v přihlášce. Ke všem vhodným kandidátům přistupujeme férově a vždy zveme k pohovoru alespoň jednoho kvalifikovaného uchazeče z těchto skupin.